Oscar Freire, vom niederländischen Rabobank Team, konnte die fünfteEtappe der Tour de France für sich entscheiden. Die Entscheidung fiel erneut am Ende der Etappe in einem Massensprint.
Nach dem Start setzten sich mehrere Fahrer vom Hauptfeld ab, unter ihnen auch der deutsche Björn Schröder vom Team Milram. Wenige Kilometer später konnten sich Schröder und derFranzose Samuel Dumoulin, der am Ende des Tages zum „Aktivsten Fahrer der Etappe“ gewählt wurde, auch von den anderen Fahrern absetzen.
Die beiden Radprofis hofften bis zum Schluss nicht mehr vom Feld eingeholt zu werden, doch die anderen Teams machten Druck und konnten die Ausreißer drei Kilometer vor dem Ziel stellen.
Im Massensprint setzte sich überraschend Oscar Freire durch. Auf dem zweiten Rang landete Tom Boonen, dieser wird sein gelbes Trikot dank der Zeitgutschrift behalten dürfen. Robbie McEwen,der bereits zwei Etappen bei dieser Tour de France gewann, kam auf Platz Fünf. Im Kampf um das grüne Trikot liegt McEwen mit einem Punkt Vorsprung vor Tom Boonen.
Erik Zabel, der heute nur Neunter wurde, befindet sich mit 76 Punkten auf Platz Sechs der Punktewertung. In der Nachwuchswertung führt der deutsche Markus Fothen vom Team Gerolsteiner.
Etappenergebnis: 5. Etappe (Stand vom 06.07.06)
| Platz | Nation | Name | Team | Zeit | |
| 1. | 
|
Óscar Freire | Rabobank | 05: 18:50 | |
| 2. | 
|
Tom Boonen | Quick-Step | + 00:00:00 | |
| 3. | |
Iñaki Isasi | Euskaltel | + 00:00:00 | |
| 4. | 
|
David Kopp |
Gerolsteiner |
+ 00:00:00 | |
| 5. |  |
Robbie McEwen | Davitamon – Lotto | + 00:00:00 | |
| 6. |  |
Alessandro Ballan | Lampre |
+ 00:00:00 | |
| 7. | 
|
Thor Hushovd | Crédit Agricole | + 00:00:00 | |
| 8. | |
Francisco Ventoso | Saunier Duval | + 00:00:00 | |
| 9. | |
Erik Zabel |
Milram |
+ 00:00:00 | |
| 10. |  |
Bernhard Eisel | Française des Jeux | + 00:00:00 |
Gesamtwertung: (Stand vom 06.07.06)